Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lrrc4Q99PH1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc4Q99PH1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms