Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tsnaxip1Q99P25 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tsnaxip1Q99P25 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms