Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Atoh8Q99NA2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms