Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SrrtQ99MR6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms