Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp1b4Q99ME6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp1b4Q99ME6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms