Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprtQ99M80 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprtQ99M80 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
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