Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Rcbtb2Q99LJ7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rcbtb2Q99LJ7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Rcbtb2Q99LJ7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Rcbtb2Q99LJ7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms