Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI2

Clcc1, Chloride channel CLIC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcc1Q99LI2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clcc1Q99LI2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clcc1Q99LI2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms