Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lactb2Q99KR3 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms