Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ciao1Q99KN2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ciao1Q99KN2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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