Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrm1Q99J25 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Mrm1Q99J25 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms