Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnf144aQ925F3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf144aQ925F3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms