Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Trim59Q922Y2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim59Q922Y2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms