Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usb1Q91W78 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usb1Q91W78 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms