Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc71Q8VEG0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc71Q8VEG0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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