Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Top1mtQ8R4U6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Top1mtQ8R4U6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Top1mtQ8R4U6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Top1mtQ8R4U6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Top1mtQ8R4U6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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