Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Atg10Q8R1P4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms