Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4J6

Mkl1, MKL/myocardin-like protein 1, mousemouse

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Length 964 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkl1Q8K4J6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mkl1Q8K4J6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mkl1Q8K4J6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mkl1Q8K4J6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mkl1Q8K4J6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Mkl1Q8K4J6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mkl1Q8K4J6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Mkl1Q8K4J6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mkl1Q8K4J6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms