Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cnot6Q8K3P5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cnot6Q8K3P5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms