Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cdk5rap2Q8K389 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cdk5rap2Q8K389 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms