Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Depp1Q8K2F3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms