Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Scara5Q8K299 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms