Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pacs1Q8K212 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pacs1Q8K212 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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