Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Neil3Q8K203 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Neil3Q8K203 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms