Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trip10Q8CJ53 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms