Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Rbm28Q8CGC6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rbm28Q8CGC6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms