Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E4f1Q8CCE9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
E4f1Q8CCE9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms