Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SynpoQ8CC35 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynpoQ8CC35 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynpoQ8CC35 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynpoQ8CC35 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynpoQ8CC35 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynpoQ8CC35 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynpoQ8CC35 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynpoQ8CC35 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SynpoQ8CC35 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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