Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

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Length 541 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Dclre1bQ8C7W7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dclre1bQ8C7W7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Dclre1bQ8C7W7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dclre1bQ8C7W7 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms