Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Bhlhe22Q8C6A8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Bhlhe22Q8C6A8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms