Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sit1Q8C503 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sit1Q8C503 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms