Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc90bQ8C3X2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccdc90bQ8C3X2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms