Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trerf1Q8BXJ2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Trerf1Q8BXJ2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms