Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWW4

Larp4, La-related protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 719 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp4Q8BWW4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Larp4Q8BWW4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Larp4Q8BWW4 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Larp4Q8BWW4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Larp4Q8BWW4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Larp4Q8BWW4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Larp4Q8BWW4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Larp4Q8BWW4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Larp4Q8BWW4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Larp4Q8BWW4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Larp4Q8BWW4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms