Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU04

Ubr7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr7Q8BU04 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubr7Q8BU04 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ubr7Q8BU04 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms