Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gga3Q8BMI3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms