Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp54Q8BL06 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp54Q8BL06 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms