Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
U2af1l4Q8BGJ9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
U2af1l4Q8BGJ9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms