Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc50Q810U5 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms