Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS9

Stkld1, Serine/threonine kinase-like domain-containing protein STKLD1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stkld1Q80YS9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Stkld1Q80YS9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms