Protein–RNA interactions for Protein: Q80US4

Actr5, Actin-related protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr5Q80US4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Actr5Q80US4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Actr5Q80US4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms