Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Avl9Q80U56 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms