Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcdh8Q7TSK3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms