Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm14905-201ENSMUST00000122351 639 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm38325-201ENSMUST00000194507 1377 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Hbp1-206ENSMUST00000176103 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Znf516Q7TSH3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Znf516Q7TSH3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms