Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssxb3Q6XAS4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms