Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc154Q6RUT8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc154Q6RUT8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms