Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Med16Q6PGF3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Med16Q6PGF3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms