Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf1cQ6PDZ2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf1cQ6PDZ2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms