Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mfsd13aQ6PDE8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms