Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp49Q6P9L4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms